Вообще бетон сам по себе влаги не боится, однако швы это слабое место куда может вода попадать и разрушать плитку. Есть какие-то защитные пропитки для этого?

Конечно же есть специальная водоотталкивающая пропитка для бетона. Я даже могу вам написать где такая продается https://htc-admix.ru/shop/propitki/vodoottalkivayuschaya-propitka-dlya-plitochny
kh-sh . Только надо правильно ее наносить и сразу покупайте с запасом, особенно если плитку у вас много. Потому что она очень быстро уходить и обрабатывать швы надо регулярно.

А не лучше ли просто затирку швов сделать и тогда туда не будет попадать ничего, даже влага. Просто надо затирку делать раствором хорошим.